工商組掌理事項如下：
一、園區廠商之工商登記（含公司登記、工廠登記、動產擔保交易登記）之規劃及執行。
二、工商服務業入區之審議及輔導管理。
三、工商行政業務（含園區事業稅捐減免證明核發、營運調查、決算書表審查、園區作業基金財務收入之內部稽核）之推動、執行及法規之研擬。
四、園區安全防護體系、警安、災害防救與緊急應變之規劃及協調。
五、外籍專門性技術性人員聘僱之許可。
六、園區物流業務之管理。
七、貿易、原產地證明書核發、貨品輸出入簽證、保稅與園區事業管理費相關業務之規劃及執行。
八、園區通關系統業務面之需求規劃整合。
九、園區民防及消防業務之協調。
十、其他園區有關工商行政、安全防護及保稅通關事項。