廢棄物清除處理機構可分為三類：公民營廢棄物清除處理機構、共同清除處理機構及由主管機關輔導設置清除處理設施。

依據廢棄物清理法第14條第2項、第28條第1項規定，廢棄物清除處理機構主要是清理一般廢棄物及事業廢棄物。