特殊教育學校員額編制如下：
一、校長：一人。
二、秘書：一人，由校長就編制內專任教師聘兼之。
三、主任、組長：各處、室置主任一人；各組置組長一人。
四、教師：幼兒部及國小部，每班置教師二人；國中部、高中部及高職部，每班置教師三人。
五、導師：
（一）幼兒部、國小部及國中部，每班置導師二人，由教師兼任之。
（二）高中部及高職部，每班置導師一人，由教師兼任之。
六、特殊專才者：依各級學校聘任特殊專才者協助教學辦法規定，由校長聘兼之。
七、教師助理員：每班置一人。但每班人數未達第六條所定最高人數二分之一者，得由各該主管機關視學生障礙程度及服務需求，核准以部分工時進用。
八、住宿生管理員：於設有學生宿舍之學校，置四人；其住宿學生人數超過二十人者，每增加十人，增置二人，但增加之學生以視覺障礙及多重障礙為主者，每增加八人，增置二人。
九、特殊教育相關專業人員及專任輔導教師：依學生需要進用六人至九人，其中專業輔導人員及專任輔導教師，至少應各置一人。
十、營養師、護理人員：除依學校衛生法規定設置外，十五班以上或設有分校者，並得增置護理人員一人。
十一、幹事、助理員、管理員、書記：按同等級學校一般標準配置。
十二、技士、技佐：設有職業類科之學校，視職業類科之實際需要，置技士、技佐一人至三人。
十三、工友、技工、駕駛：
（一）工友：學生以聽覺障礙為主之學校，每四班置工友一人。學生以視覺障礙、智能障礙及肢體障礙為主之學校，十二班以下置工友六人，十三班以上，每四班增置一人。設有學生宿舍者，住宿學生人數在二百人以下，增置四人，超過二百人者，每滿一百人增置一人。
（二）技工、駕駛：視實際需要配置。
十四、專任運動教練：視實際需要配置從事運動團隊之訓練或比賽指導。
前項第二款之秘書及第三款之主任、組長，除復健組得由專任之特殊教育相關專業人員兼任，及總務處各組組長為專任外，由校長就教師聘兼之。
第一項第八款住宿生管理員，應為高級中等以上學校畢業或具同等學歷之資格，經各校甄審委員會公開甄選進用，並於到職後一個月內，報各該主管機關備查。除職前訓練外，每年並應接受學校或各該主管機關辦理九小時以上之在職訓練。
第一項第九款特殊教育相關專業人員如下：
一、醫師：具有專科醫師資格之醫師。
二、物理治療師、職能治療師、語言治療師及聽力師等專業人員。
三、職業輔導、定向行動等專業人員。
四、專業輔導人員：指具有臨床心理師、諮商心理師或社會工作師證書之人員。
第一項第九款專任輔導教師，應符合學生輔導法施行細則第二條至第四條所定資格。
特殊教育學校設有分校或分部者，另增置主任一人，由教師兼任。