活魚運搬船漁業人或漁業從業人有下列情形之一者，依本法第六十五條第八款規定處新臺幣三萬元以上十五萬元以下罰鍰；情節重大者，廢止其作業許可：
一、違反第十條規定，未於每航次出港前申請許可即出港作業，或未接受海岸巡防機關檢查。
二、違反第十一條、第十二條或第十五條規定，裝卸清單或共同合作運搬養殖活魚紀錄表填報內容或上傳文件不實。
三、違反第十三條第一項規定，未與養殖漁民或中轉場負責人將養殖活魚共同封緘各自留樣，或未自活魚運搬船出港日起凍存三個月。
四、違反第十三條或第十四條第二項規定，規避、妨礙或拒絕檢驗或調查。
五、違反第十六條第一項或第二項規定，未於每航次出港前通報及確認船位回報正常，或出港後未維持船位回報器於開啟狀態，或出港後未每小時自動回報船位，或返港後未通報即擅自關閉船位回報器。
六、違反第十六條第四項規定，未依限期返港，或未依規定通報船位，或船位通報不實，或未完成修復船位回報器即擅自出港。
七、違反第十七條第二款規定，運搬非活體型態之魚貨或第二條第一款所定養殖活魚以外之水產動植物。
八、違反第十七條第八款規定，收取費用經營運送業務。