園區事業於辦妥設立登記，並經海關核准公告監管後，始得由國外進口保稅貨品。

園區事業進口保稅貨品應依海關相關規定，設立保稅帳冊，並指派專職人員辦理保稅業務。

園區事業尚未辦妥設立登記而需自國外進口保稅貨品者，得檢具土地或廠房租賃契約等文件，向管理局申請專案進口保稅貨品。

前項專案申請應先向海關繳納進口稅款保證金，始得辦理通關手續，並於辦妥設立登記，且經海關公告監管後，再向海關申請退還進口稅款保證金。

園區事業於辦妥設立登記，並經海關核准公告監管後，得檢具有關文件向管理局申請辦理保稅貨品自行點驗進出區及按月彙報業務。

依法令規定合併或分割後存續或新設之園區事業，得申請承受合併消滅或分割前已取得之自行點驗進出區及按月彙報資格。

已具備自行點驗進出區及按月彙報資格之園區事業，位於不同園區之分廠，得向分廠所在地之管理局申請辦理自行點驗進出區及按月彙報之業務。

園區事業於區外之總公司或分公司已具備自行點驗進出區及按月彙報資格者，得向管理局申請辦理自行點驗進出區及按月彙報之業務。

園區事業經核准辦理自行點驗進出區及按月彙報業務者，應聘任二名以上之保稅業務人員（其中一名應為保稅業務主管級人員）辦理保稅業務，並報請海關核准後副知管理局。

園區事業保稅業務人員應具國內、外高中或高職以上學校畢業（含同等學歷資格）或普通考試（含丙等特考）以上考試及格，並應符合下列資格之一：

園區事業經核准自行點驗進出區及按月彙報業務者，其視同進出口案件、委外加工案件、受託加工案件、借料及價值未逾海關核定免繳保證金限額之保稅貨品，運往區外展示、修理、檢驗、組裝測試之案件，得自行點驗進出區。

前項屬視同進出口案件者，得先憑交易憑證文件登帳，於次月十五日前繕具報單，檢附報關必備文件，向海關辦理按月彙報，並應於出區前取得輸出入規定文件。

按月彙報案件，其最後一批貨品進出區日期視同進、出口日期。

園區事業應於製造新產品之翌日起一個月內，產品未出區前，造具各種產品單位用料清表，送海關備查。未送海關備查，而產品已先行出區者，不予除帳。

前項期限，因產品特性或實務作業特殊需求，得經海關專案核准延長之。

第一項產品單位用料清表有申報不實之虞者，海關得予以查核並要求提出製造程序說明書及其他有利查核之相關文件。

園區事業應備置保稅貨品帳冊，報請海關驗印，驗印後依海關規定詳細記錄進、出倉數量、倉庫結存數量及動態紀錄等，供管理局及海關隨時查核之用。

園區事業進口之非保稅原料、物料，可與其他保稅原料、物料相互替代使用者，應一併登列於原料、物料帳管理，並於年度結算時分項列明，合併計算。

園區事業有關保稅之帳冊及編製之表報，應於年度盤存結束後，保存五年；其有關之憑證應保存三年。

前項資料，園區事業得於盤存結案後報經海關核准，以微縮影片、磁帶、磁碟片、光碟片或其他電子媒體等按序攝錄後，依規定年限保存，其原始單證得予銷毀。海關依法進行查案時，如須複印相關資料，園區事業應負責提供。

園區事業應依本條例第二十六條第一項規定備置帳冊，供管理局及海關查核。

園區事業應每年盤存一次，每二年會同會計師盤存一次。但經海關認證為安全認證優質企業或保稅帳冊製作完善，保稅貨品管理健全之園區事業，得於會同會計師盤存之年度盤存日或盤存期限屆滿日一個月前，向海關申請免會同會計師盤存。

盤存日期距上年度盤存日期最短不得少於十個月，最長不得超過十四個月；有特殊情形、事先報經海關核准者，得酌予提前或延長之；海關及管理局認有必要時，得隨時予以盤存。

前項盤存，其未經抽查之項目事後發現錯誤或漏列，且未移往課稅區前，機器設備應於盤存後一個月內向海關申請複查；其餘貨品應於盤存後二週內向海關申請複查，屆期不予受理。

園區事業應於盤存後三個月內根據盤存清冊編製保稅貨品盤存統計表及結算報告表，連同在製品、半製品、成品盤存數折合原料分析表及內外銷成品折合原料分析表，送請海關審核。但有特殊原因，經申請海關核准者，得延長一個月，並以一次為限。

園區事業以研究發展為主要業務且保稅貨品僅有機器、設備者，免會同會計師盤存。

依第一項會同盤存之會計師，以依會計師代理所得稅事務辦法規定核准登記為稅務代理人有案之會計師為限。

具自行點驗進出區及按月彙報資格之園區事業，於年度盤存，其由會計師辦理及簽證者，得免會同海關辦理。由會計師簽證之年度結算報告表，海關得免審核。

園區事業得於盤存日一個月前向海關申請辦理假日盤存。園區事業管理制度健全，保稅貨品控管良好，於盤存當日作業前即能編妥盤存清冊，且符合下列條件之一者，得於盤存日一個月前，向海關申請辦理生產線不停工盤存：

經海關核准辦理不停工盤存之園區事業，應提供有關生產線上保稅貨品相關表報，供稽核關員即時查核，其生產線上之保稅貨品得免編製貨品盤存卡。

海關派員會同盤存時，發現以不停工方式無法查核或有重大弊端時，得令其停工接受盤存或另訂日期停工重盤。

園區事業依前條規定辦理盤存之保稅貨品與當年度帳面結存數量不符時，依下列規定辦理：

園區事業之同一種類或可相互替代使用之原料或物料，其部分為保稅，部分為非保稅，於年度結算時應一併列入盤存。

園區事業之原料盤差容許率依照海關管理保稅工廠分業分類原料盤差容許率表辦理之。

園區事業於撤銷或廢止投資核准、解散或遷出區外前，應依下列規定辦理結束盤存：

園區事業宣告破產者，保稅貨品應依破產法及其相關規定辦理，其因生產或外銷之需要者，得由園區事業提供相當之保證金，經海關核准後提領使用，並應於提領之翌日起一年內檢附出口證明文件向海關辦理銷案，屆期未銷案者，由海關就保證金抵繳應納稅捐。

經撤銷或廢止投資核准、解散、遷出區外或營運不善破產而清算之園區事業，因故無法辦理結束盤存時，海關得逕依帳面結存數課徵應補稅捐。

園區事業進口貨品因退貨、調換或其他原因得申請復運出口。

前項復運出口應繕具報單，依一般貨品輸出規定向海關辦理通關手續。

課稅區廠商售予園區事業自用之機器、設備、原料、物料及半製品，依本條例第二十五條規定視同外銷，買賣雙方應聯名繕具報單，檢附報關必備文件等，向海關辦理通關手續，經海關放行後，核發視同出口報單副本交賣方廠商憑以辦理沖退及減免稅捐。

前項具自行點驗進出區及按月彙報資格之園區事業，得於交易後次月十五日前，向海關辦理按月彙報。

保稅工廠、保稅倉庫、科技產業園區區內事業、物流中心或農業科技園區之園區事業以保稅貨品售予或輸往園區事業，視同出口及進口，買賣雙方應聯名繕具報單，檢附報關必備文件，向海關辦理通關手續。

園區事業以保稅貨品售予或輸往保稅工廠、農業科技園區之園區事業或科技產業園區區內事業，或進儲保稅倉庫、物流中心者，視同出口及進口，買賣雙方應聯名繕具報單，檢附報關必備文件，向海關辦理通關手續。

前二項視同出口及進口案件，具自行點驗進出區及按月彙報資格之買賣雙方，得於交易後次月十五日前，向海關辦理按月彙報。

自由港區事業貨物售予或輸往園區事業或園區事業保稅貨品售予或輸往自由港區事業，依自由貿易港區貨物通關管理辦法相關規定辦理。

視同外銷貨品發生退貨情事時，應於進廠後三個月內由買賣雙方聯名填具退貨申請書，報經海關核准；原已核發視同出口證明文件者，應收回註銷或更正，並通知有關機關註銷或更正。已辦理沖退或減免稅捐者，應繳回已沖退稅款並通知所屬稅捐稽徵機關，始可退貨出區。

進廠三個月後發生之退貨案件，應繕具報單依一般貨品進口之規定辦理通關手續，並依法課稅。

前條視同出口及進口貨品發生退貨情事時應由買賣雙方聯名繕具報單，檢附報關必備文件，向海關辦理通關手續。

園區事業以成品出口，應繕具報單依一般貨品出口之規定向海關辦理通關手續。

前項在園區通關之出口貨品，應由海關在指定倉庫或地點查驗，經放行後監視裝入保稅卡車、貨櫃加封交運，並簽發貨櫃（物）運送單，隨貨封送出口地海關，經出口地海關核明後，以貨櫃（物）運送單第二聯送回海關銷案。園區事業出口離岸價格逾二萬美元或戰略性高科技之貨品以其指派之人員隨身攜運出境者，經向園區海關辦理通關放行加封，併同園區事業貨品攜帶出口運送單，送交出口地海關辦理到貨註記後監視出境。但在運送途中遺失者，應由園區事業補繳稅捐。

園區事業進、出口貨品得選擇在進、出口地海關依通關之作業規定辦理通關手續。

園區事業以成品售予稅捐記帳之外銷加工廠再加工外銷者，買賣雙方應聯名繕具報單，檢附報關必備文件，向海關辦理通關手續。

前項外銷加工廠之稅捐記帳，應依外銷品沖退原料稅辦法之規定辦理，並以海關簽放報單日期為視同出口及進口之日期。

園區事業以保稅貨品售予同區內或其他園區之園區事業，買賣雙方應聯名繕具報單，檢附報關必備文件，向賣方海關辦理通關手續。

前項園區事業售予同區內園區事業，於交易後次月十五日前，向海關辦理通關手續，並得採按月彙報及自行點驗進出區；售予其他園區之園區事業，得依第五條及第六條規定辦理自行點驗進出區及按月彙報。

園區事業以其產品作為樣品或贈品，售予或贈送國內外廠商及參觀之客戶，其非屬貿易主管機關公告限制輸出入貨品項目者，依下列規定辦理：

前項第三款、第四款貨品未能銷案，亦未運回廠內者，應於銷案期限屆滿後十日內，繕具報單按出廠型態補稅。

園區事業以其原料、零組件、物料及設備交與到廠之國外客戶、廠方人員或快遞業者出口至國外測試、維修，非屬貿易主管機關公告限制輸出入貨品項目，且價值未逾貿易主管機關依貨品輸出、入管理辦法所訂限額者，準用第一項第三款規定辦理。

第一項第三款及前項之限額得由管理局會同海關依實際狀況彈性調整。

第一項第三款申請案件得以電子傳輸方式辦理。

園區事業輸出入之貨品，數量在十件以下，每件毛重未逾二十公斤，其輸入時，得填具園區事業空運或郵寄少量原料包裝加封交運進廠申請書，向進口地海關申請核准，交由該園區事業所派人員攜運進廠，並向海關辦理通關手續；以郵寄輸出時，應向海關辦理通關手續經海關驗放後交郵寄出口。

前項貨品在運送中遺失者，應由園區事業補繳稅捐。

由課稅區輸入園區保稅範圍之貨品，其不申請減免或退稅者，得免辦手續入區。

園區事業購進機器，日後有退回、掉換或運返課稅區者，於運返課稅區時，由該園區事業填具「科學園區生產性貨品出區放行單」出區。

內銷或輸往課稅區之保稅貨品，應繕具報單，報經海關補徵進口稅捐後，始准放行。

前項保稅貨品屬貿易主管機關公告限制輸出入貨品項目者，須經管理局或相關主管機關核准。屬售予課稅區廠商再加工外銷者，應另行向海關申請沖退稅用報單副本，供加工外銷出口後辦理退稅。

前二項保稅貨品，發現損壞或規格、品質與原訂合約不符，須由園區廠商賠償或調換者，該項賠償或調換之出區貨品，免繳關稅。

前項免繳關稅貨品應於原貨品放行後一個月內提出申請，並檢附有關證件，經海關查明屬實者為限。其機器、設備內銷或輸往課稅區後，運回園區修理、裝配者，應依關稅法相關規定辦理。

第一項保稅產品依下列方式之一課徵關稅：

前條保稅貨品，得依第五條、第六條及下列規定辦理自行點驗進出區及按月彙報業務：

前項屬非交易行為之保稅貨品於海關放行後須留置原廠區者，應採逐筆申報方式通關，不適用前項規定。

園區事業在生產過程中所產生之副產品、廢品、下腳及次品，均應按類別、性質依序儲存於倉庫或經管理局及海關認可之地點，屬半製品之廢品，並應分別列明以備查核。

前項所稱副產品，指在生產目標產品過程中，附帶產出之其他產品。

第一項所稱廢品，指園區事業所有不堪使用之機器、設備、零組件或材料，其本身事業不能利用者；或未經製造過程，仍屬資產之一部分者；或其產品及設備因災害受損，本身事業不能利用，仍屬資產之一部分者。

第一項所稱下腳，指園區事業在其製造過程中，所殘餘之渣滓、廢料，為該事業不能利用者。

第一項所稱次品，指產品存在未達客戶要求品質之缺陷或瑕疵，但具備產品全部或部分功能，仍可供銷售者。

前條副產品、廢品、下腳及次品之報廢，應依下列規定辦理：

前項廢品、下腳，其未在產品單位用料清表用料量中另列有損耗率或未經核准者，得核實沖銷保稅原料帳。

第一項報廢作業程序，得以電子傳輸方式辦理，且園區事業應依據廢棄物清理法之規定處理。

第一項報廢銷毀案件，其經海關認證為安全認證優質企業之園區事業，得免監毀；安全認證優質企業以外之其他園區事業，其下腳本身無須除帳，經管理局及海關認定已屬毀損狀態者，該品項得免監毀。

園區事業間借入、借出及歸還原料、物料、燃料、半製品、成品，應由雙方聯名填具「園區事業借入（出）原料、物料、燃料、半製品、成品申請書」，向海關申報辦理驗放及進（出）廠手續，並由各該園區事業點收或歸還銷案後登入帳冊。

前項案件得依第五條、第六條規定，辦理自行點驗進（出）廠，並於進（出）廠五日內檢送「園區事業借入（出）原料、物料、燃料、半製品、成品申請書」向海關報備。

前二項由園區事業借出之原料、物料、燃料、半製品或成品，應自借出之日起三個月內歸還，屆期不還或未向海關銷案者，應即依第二十五條規定補辦通關及轉帳手續，其情節重大者，並得停止受理雙方園區事業借出入案件之申請半年。

園區事業之原料或半製品運往課稅區加工所委託加工之廠商，以從事科學技術研究發展之研究機構或已辦妥工廠登記之工廠為限。

園區事業之原料或半製品委託課稅區廠商加工，應檢附合約書或經委、受託加工雙方簽署之訂單、加工廠商之工廠登記證明文件，向管理局申請核准。但園區事業委託其設立於課稅區分廠之委託加工案件，合約或訂單得以其他相關證明文件代替。本項作業之申請，得以電子傳輸方式辦理，並應於核准後一年內運出園區加工。

前項委託加工案件，加工廠商所添加之原料不得申請退稅。

園區事業之原料或半製品得委託科學園區園區事業、科技產業園區區內事業、農業科技園區之園區事業或保稅工廠加工，加工廠商所添加之保稅原料得申請除帳。

園區事業以自己名義由加工廠商或設立於其他關區之分廠處直接出口加工品者，逕憑出口報單向海關結案。

第二項及第四項委託加工案件，以貨物運出廠（區）日期起算一年內為限，屆期未運回者，應自期限屆滿之次日起十日內繕具報單補稅。

園區事業自備之保稅模具得經管理局核准後，供委託加工之加工廠商使用。但屬前條第四項情形，得免申請核准。

前項申請方式及期限，依前條委託加工之規定辦理。

區外廠商得以其原料或半製品委託園區事業加工。但課稅區廠商委託時，以向主管機關辦妥公司或商業組織登記者為限。

園區事業受託加工，須添加保稅原料者，於加工品出區前，應準用第七條規定造具產品單位用量清表，及加註受託加工案件字樣送海關備查，並繕具報單向海關辦理通關手續，海關於審核報單時，得要求提供委託加工證明文件。

本條加工品出區，得準用第三十二條規定程序辦理自行點驗進出區及按月彙報。

園區事業之保稅貨品運往區外委託代為修理、檢驗或組裝測試者，應填具科學園區保稅貨品運出區修理、檢驗或組裝測試申請書報請海關審核並繳納稅款保證金後放行出區。

前項保稅貨品，價值未逾海關核定限額者，得免繳保證金，逕憑生產性貨品出區放行單向海關申請出區；其具自行點驗進出區及按月彙報資格者，得免向海關申請出區手續。

園區事業進口或自其他科學園區園區事業、科技產業園區區內事業、農業科技園區園區事業、保稅倉庫、物流中心、自由港區事業或保稅工廠購買之保稅貨品，經管理局核准，向海關申請於繳納稅款保證金後，得直接運至區外委託檢驗、組裝測試，並應於完成後運回；其保稅貨品屬價值未逾海關核定限額者，得免繳保證金。

本條保稅貨品之進出區紀錄之管理，準用第八條規定辦理。

第一項至第三項作業，得以電子傳輸方式辦理。

前條保稅貨品修理、檢驗或組裝測試後，應於出區或管理局核准日後一年內運回，運回區內時應填具園區事業出區保稅貨品運回進廠申請書，向海關辦理銷案及退還保證金手續。未依限運回者，應於期滿後十日繕具報單補稅。

前項作業，得以電子傳輸方式辦理。

園區事業產品或供貿易用成品出區展示，應填具園區事業產品或供貿易用成品出區展示申請書報請海關審核並繳納稅款保證金後放行出區。出區展示產品或供貿易用成品運回時，應填具園區事業出區展示產品或供貿易用成品運回進廠申請書向海關辦理銷案手續；本項作業，得以電子傳輸方式辦理。

前項產品或供貿易用成品價值未逾海關核定限額者得免繳保證金，逕憑生產性貨品出區放行單向海關申請出區手續；其具自行點驗進出區及按月彙報資格者，得免向海關申請進出區手續。

產品或供貿易用成品出區展示時間不得超過六個月，情形特殊者，得於期限屆滿前申請展期，其合計期限不得超過一年，期滿即應運回，未依期限運回者，應於期滿後十日繕具報單補稅。

園區事業登記之區內營業項目包括維修者，得辦理相關產品之修理及其所衍生之檢驗、測試或維護（以下簡稱維修產品）業務，並設置維修產品之存放專區，及編製維修專用帳冊報經海關驗印，向海關辦理通關手續。

前項帳冊如以電腦處理者，準用第八條第四項規定辦理。

維修產品為園區事業自國外進口者，得暫免向海關提供相關擔保，惟應於進口放行之翌日起六個月內復運出口；其情形特殊者，得於期限屆滿前以書面敘明理由向海關申請延長，延長期間以六個月為限。未於期限屆滿前出口者，應於期限屆滿之翌日起十日內繕具報單補稅。

維修產品自保稅工廠、科技產業園區區內事業、農業科技園區園區事業、保稅倉庫、物流中心及自由港區事業運入者，園區事業準用第二十條第三項規定辦理自行點驗進出區及按月彙報業務。

維修產品有使用保稅原料維修者，應於該產品出口（廠）前，向海關申報裝卸之保稅原料、零組件對照清表備查，逾期未送備查者不予除帳；其拆卸之零組件應登列專用帳冊控管，相關出口、補稅及報廢程序，準用第二十條、第二十二條第一項、第三十一條第一項及第三十四條規定。

維修產品應列入年度盤存結算，經結算結果，結存數量與盤存數量不符時，應敘明理由報請監管海關查明原因，並準用第十二條規定。