隔離檢疫物於隔離檢疫期間，輸入人應依核准之內容管理，並依下列規定辦理：
一、隔離檢疫物之全部、部分及其衍生物，未經植物檢疫機關同意，不得擅自移出隔離圃場。
二、人員進出隔離圃場與相關肥料、藥劑、栽培介質及資材進出及使用時，應留有紀錄備查。
三、使用過之栽培介質、資材、產生之廢液廢水及植物殘體應集中，並以植物檢疫機關規定之消毒方法消毒後，始得丟棄或排出，並應留有紀錄備查。
四、有移出入其他檢疫物情形，應經植物檢疫機關同意。
五、發現隔離檢疫物死亡或感染有害生物時，應立即通知植物檢疫機關，並依檢疫人員指導處置，或由植物檢疫機關逕行處置；其所需費用由輸入人負擔。
輸入人提供之隔離圃場應保持安全隔離設施完整性，不得擅自變更。有損壞或其他因素致不符合第五條規定時，應通知植物檢疫機關人員，並立即採取安全處理措施。
隔離檢疫物於植物檢疫機關或指定之隔離圃場內實施隔離檢疫者，輸入人應依相關規定支付費用。