經核准登記之保稅倉庫，應由海關及倉庫業者共同聯鎖。但經海關核准自主管理之保稅倉庫及設立於科技產業園區、科學園區、農業科技園區、國際機場與港口管制區內者，得免聯鎖。

海關對免聯鎖之保稅倉庫於必要時得恢復聯鎖或派員駐庫監管。

貨物進出保稅倉庫，需由海關派員往返監視起卸貨物時，如因時間急迫，得由倉庫業者、有關輪船公司或航空公司提供交通工具；如需派員常駐監視，倉庫業者應供給該員辦公處所。

前項須由海關派員監視者，倉庫業者應依海關徵收規費規則有關規定繳納監視費。

保稅倉庫儲存之貨物，如經全部完稅或移倉，海關得應保稅倉庫業者之請求，准予暫行停業，停業期間，免徵規費。

保稅倉庫經准予暫行停業或事實上停業已滿二年者，海關得命其於一個月內復業、進儲貨物或提出合理說明，屆期不為者，海關得廢止其登記。

本辦法自發布日施行。但中華民國九十五年六月二十八日修正發布之第八條及第九條規定，自九十五年六月二十八日施行。

本辦法中華民國一百零四年七月二十四日修正發布之條文，自一百零五年三月十二日施行。但第四條、第二十四條第五款及第四十八條自發布日施行。