所得利益計算期間之起算日，以認定其違反本法規定之日起為起算日。停止日依下列規定辦理：
一、經主管機關命採取必要防治措施、限期補正或改善者，自命其採取必要防治措施、補正或改善之日起為停止日。
二、經處分機關、目的事業主管機關命停工（業）、歇業或停止污染行為者，自命其停工（業）、歇業或停止污染行為之日為停止日。
三、自報停工（業），經主管機關查證屬實者，自其自報停工（業）之日為停止日。
經主管機關查驗認定未依規定採取必要防治措施、完成補正、改善、停工（業）、歇業或停止污染行為者，應就前項停止日至主管機關查驗認定實際已採取必要防治措施、完成補正、改善、停工（業）、歇業或停止污染行為之日期間另行計算所得利益總和。
所得利益追繳期限適用行政程序法第一百三十一條第一項之規定。