香港或澳門居民申請進入臺灣地區，有下列情形之一者，得不予許可；已許可進入者，得撤銷或廢止其許可，並註銷其入出境許可證：
一、曾未經許可入境。
二、現（曾）經許可入境，已逾停留、居留期限。
三、現（曾）有從事與許可目的不符之活動。
四、現（曾）有事實足認為有犯罪行為。
五、現任職於大陸地區行政、軍事、黨務或其他公務機構或其於香港、澳門投資之機構或新聞媒體。
六、原為大陸地區人民，未在大陸地區以外之地區連續住滿四年。
七、現（曾）冒用身分或持用偽造、變造證件申請或入境。
八、現（曾）有依本辦法規定申請時，為虛偽之陳述或隱瞞重要事實。
九、現（曾）在臺灣地區有行方不明紀錄達二個月以上。
十、現（曾）有危害國家利益、公共安全、公共秩序、善良風俗或從事恐怖活動之虞。
十一、現（曾）依其他法令限制或禁止入境。
前項不予許可之期間如下。但有第十二條第一項各款情形之一，未辦延期，逾停留期限十日以內者，不在此限：
一、有第一款、第七款或第八款情形：二年至五年。
二、有第二款、第三款或第九款情形：一年至三年。
三、有第四款情形：一年至五年。
前項不予許可期間之計算，已入境者，自出境之日起算；未入境者，自不予許可、撤銷或廢止許可之翌日起算。
香港或澳門居民為跨國（境）人口販運之被害人，有進入臺灣地區協助偵查或審理之必要，經檢察官或法官認定其作證有助於案件之偵查或審理者，不受前二項期間之限制。
第一項第五款及第十款情形，移民署得會同國家安全局、大陸委員會及相關機關審查。