法務二科掌理綜合所得稅、遺產稅、贈與稅、貨物稅、菸酒稅、證券交易
稅、期貨交易稅、特種貨物及勞務稅等行政救濟案件及各稅違章案件之處
理等事宜。分設三股，各股之職掌如下：
一、行政救濟一股、二股：
（一）復查案件之處理。
（二）訴願、行政訴訟案件之答辯、補充說明及證據調查與言詞辯論之代
理。
（三）行政救濟案件案例之分析及研究改進事項。
（四）違反記帳士法第三十四條案件之行政救濟等事項。
二、違章管制股：
（一）行政救濟及違章案件之派查、管制及催辦。
（二）各稅非簡易違章案件之審理、裁罰及督導。
（三）違章裁罰案件處分書之處理。
（四）檢舉人獎金之提成及核發。
（五）違反記帳士法第三十四條案件之審理、處罰等事項。
（六）其他有關各稅行政救濟（營業稅及營利事業所得稅除外）及違章派
查、管制及催辦行政事項。