本基金之用途如下：
一、預防接種受害救濟之給付事項。
二、辦理預防接種副作用之防治及通報事項。
三、辦理減少預防接種副作用之獎勵、研究及策略研訂事項。
四、辦理預防接種受害救濟及預防接種副作用之國際合作事項。
五、辦理預防接種受害救濟之受理、調查及審議事項。
六、委託或補助辦理預防接種受害救濟相關事項。
七、管理及總務支出。
八、其他有關支出。