秘書室掌理文書、事務、出納、檔案等事宜。分設四股，各股之職掌如下
：
一、文書股：
(一) 公文書 (含電子公文、電子郵件) 之總收文及分文。
(二) 文稿之收繕、校對、用印及封發。
(三) 文稿之銷號及歸檔。
(四) 各單位公文收發人員作業之訓練、督導及考核。
(五) 印信之典守。
(六) 其他有關文書行政事項之處理。
二、事務股：
(一) 土地及建築物之產權登記、維修及管理。
(二) 財產之接管、維護、報廢及變賣。
(三) 宿舍管理及維修。
(四) 辦公設備、物品購置、核發及保管。
(五) 駕駛、技工、工友之僱免及管理。
(六) 各種車輛之調派、管理及肇事處理。
(七) 油摺、通行費、水電、瓦斯費、電話、環境衛生、節約能源及推動
環保之管理。
(八) 會議場、禮堂等處所之管理。
(九) 防護團之組訓事宜。
(十) 營建及修繕工程。
(十一) 工友、約聘僱人員及工讀生勞保健保加保、退保事宜。
(十二) 員工交通費管理。
(十三) 工友福利互助管理。
(十四) 員工輔購住宅案件管理。
(十五) 辦公室建築物安全檢查及消防檢查管理。
(十六) 其他有關事務行政事項之處理。
三、出納股：
(一) 零用金核銷及保管。
(二) 各項出納帳簿、表報之編製及登帳。
(三) 黃金及外幣之原封、有價證券、公債、存單等擔保品寄存中央銀行
轉委託之代理國庫金融機構辦理後，所發給寄存證之保管。
(四) 各項公款、押標金之收受及存庫。
(五) 各項經費之支付。
(六) 員工薪資、獎勵金、罰鍰獎金、年終獎金、考績獎金、交通費、加
班費、差旅費、休假補助費、不休假加班費、月退休金及三節慰問
金等之發放。
(七) 保險費、住宅貸款、急難貸款、優惠存款、信用扣款、小額貸款、
所得稅等之扣繳。
(八) 扣免繳憑單之填發申報。
(九) 其他款項之代收及代付。
(十) 付款憑單之遞送及電子支付傳輸作業之執行。
(十一) 其他有關出納行政事項之處理。
四、檔案股：
(一) 歸檔文稿之點收及銷號。
(二) 歸檔文稿之分案、立卷及點藏。
(三) 歸檔文稿之整理、歸卷、裝訂及典藏。
(四) 逾期檔案之銷燬。
(五) 檔案調、閱卷之管理。
(六) 卷櫃之調整及整理。
(七) 其他有關檔案行政事項之處理。