內部審核人員之權責如左：
一、內部審查人員執行內部審核任務前應詳細研閱本辦法與有關法規、資
料，並予靈活運用。
二、主辦主計軍官對不合法之會計程序或文書，應依會計法第九十九條規
定辦理。
三、各單位主計人員對不合法之會計憑證，應依會計法第一零二條規定辦
理。
四、對受審核單位有關之業務案卷、簿籍、憑證、金錢財物、內部管理及
其工作場所，均有審核之權。
五、必要時，對有關資料憑證、財物、金櫃等，可臨時予以封存。
六、得向受審核單位及有關人員提出詢問，或索取相關審核事項之文件與
證明。
七、得因事實需要，抽查本次審核有關資料。
八、得檢討受審核單位之工作績效。
九、對於已失效或不合實際需要之法令，得研究建議主管單位修正或廢止
。
十、發現受審核單位，對支用經費，有超越權責，不當不實，違反節約規
定，或強行消化預算之情形者，得列舉事實，建議權責單位核減其相
關預算並查處有關失職人員。
十一、對蒐集與瞭解受審核單位之案件內容，文件資料等，負有保密（管
）之責。
十二、屬於機密性業務、其案卷、簿籍、憑證、財物等，由受審核單位事
先呈報審核單位主官同意，另行指派人員，或授權該單位主官派員
查核者，應免予查核。
前款所稱機密性業務應依據「軍機保密實施規定」第一章第四節機
密等級之分類標準辦理。
十三、對發現受審核單位重大業務缺失事項，不負直接糾正責任。
十四、不得代表審核單位，向受審核單位為任何之承諾，且無解除該單位
各級人員會計與行政責任之權。
十五、在提呈審核報告前，應將所審事項，先與受審核單位業務主管人員
，完成初步協調。
十六、執行審核，除有特殊情形，應在計畫核定時程內及受審核單位作息
時間內行之。
十七、內部審核人員執行內部審核事項應依照有關法令辦理，非因違法失
職或重大過失，不負損害賠償責任。
十八、對查證屬實之不當、不實案件，應要求各受審核單位之相關人員於
原案或查證記錄上簽章證明，受審核單位不得拒簽。