審查四科掌理營業稅及虛設行號之調查、核定及相關行政等事宜。分設三
股，各股之職掌如下：
一、營業稅一股：
（一）營業登記及稅籍管理有關事項。
（二）營業稅申報作業相關業務（含電子申報作業）。
（三）統一發票管理及規劃等相關事項。
（四）電子發票相關業務。
（五）營業人申請自行印製收銀機統一發票事項。
（六）查定課徵綜合事項。
（七）兼營營業人調整稅額綜合事項。
（八）績優營業人選拔事項。
（九）營業人合併總繳及撤銷總繳相關業務。
（十）營業人放棄免稅有關業務。
（十一）記帳及報稅代理業務人、記帳士執業登錄作業與記帳及報稅代理
業務人專業訓練機構之管理。
（十二）分局、稽徵所營業稅稽徵業務之規劃、督導及考核。
（十三）營業稅責任目標之擬定及績效統計。
（十四）營業稅法令疑義之請釋及解答。
二、營業稅二股：
（一）專案作業計畫之擬訂及推動。
（二）虛設行號之查核及管制。
（三）出口及退稅相關作業事宜。
（四）外籍旅客退稅作業相關事項。
（五）外商來台參展退稅作業。
（六）統一發票稽查作業綜合事項。
（七）停止營業處分核定事項。
（八）交查異常及課稅資料通報查核管制事項。
（九）營業稅法令疑義之請釋及解答。
（十）其他區局通報營業稅案件之核轉。
（十一）公文之收發及管制。
（十二）案件之派查、稽催及管制。
（十三）其他行政事項之處理。
三、專案查核股：
（一）虛設行號之查核。
（二）選案查核作業相關業務。
（三）其他重要交辦事項。