非我國籍漁船進入正濱漁港或前鎮漁港前，應於基隆港或高雄港完成航政、關稅、衛生、移民、防疫、檢疫等檢查。
非我國籍漁船經許可進入前項漁港者，其停泊期間，不得超過五日。但需延長時間卸魚者，代理人得於期限屆滿前，向主管機關申請展延，展延最長三日，並以一次為限。
進入我國漁港之非我國籍漁船載有大陸船員者，應配合海岸巡防機關及警察機關辦理安全檢查；經檢查無誤後，經營者應將大陸船員暫置於岸置處所或暫置區域內之原僱用漁船。
大陸船員暫置於岸置處所或暫置區域之原僱用漁船時，經營者應約束大陸船員不得擅離暫置場所；其暫置期間所需相關費用，由經營者支付。
大陸船員需搭機離境者，應依大陸地區人民進入臺灣地區許可辦法規定，向內政部移民署申請入出境。