有下列情形之一者，應依本條例第三十六條規定處罰：
一、運搬船從事轉載，未遵守第五十三條第一項規定，規避、妨礙或拒絕搭載觀察員或接受主管機關指派之觀察員隨船執行任務。
二、違反第五十六條第一項規定，未經許可即從事轉載。
三、違反第五十六條第三項規定，未於許可轉載期間內轉載。但不包含第二項第二款情形。
四、違反第六十一條第一項規定，未經許可從事卸魚。
五、違反第六十一條第三項規定，未於許可卸魚期間內卸魚。但不包含第二項第五款情形。
六、違反第六十三條第一項規定，有規避、妨礙或拒絕漁獲查核，或未配合辦理同條第二項規定事項。
有下列情形之一者，應依本條例第四十一條規定處罰：
一、我國籍運搬船違反第五十條規定，與未列名在IOTC漁船名單、塗改船名或統一編號之漁船進行轉載、加油或補給。
二、屬第五十六條第三項但書之漁船或運搬船，有下列情形之一者：
（一）未於許可轉載期間內，從事海上轉載。
（二）許可轉載期間後，於前鎮、小港臨海新村或東港鹽埔漁港從事港內轉載。
三、違反第五十九條規定，於船位回報器斷訊未修復前進行轉載。
四、違反第六十條規定，未於規定期限內報送轉載確認書。
五、屬第六十一條第三項但書之漁船，有下列情形之一者：
（一）未於許可卸魚期間內，於日本清水或燒津港口卸魚。
（二）許可卸魚期間後，於前鎮、小港臨海新村或東港鹽埔漁港卸魚。
六、違反第六十二條規定，未於規定期限內提交卸魚聲明書。