檢驗機構應填具申請書，並檢具下列文件、資料，向中央衛生主管機關申請認證：
一、符合前條所定條件之證明。
二、檢驗能力之證明。
三、依中央衛生主管機關公告之檢驗機構實驗室品質系統基本規範編製之下列文件：
（一）品質手冊。
（二）檢驗方法標準作業程序，其內容包括檢驗結果品質管制之措施。
（三）申請定量檢驗項目者，應提供其量測不確定度之評估報告。
（四）申請認證之檢驗項目，中華藥典、臺灣中藥典未有檢驗方法者，其方法確效試驗評估報告。
（五）認證檢驗項目之檢驗報告出具格式、報告簽署人中文正楷簽名。
四、實驗室位置簡圖及檢驗設施配置圖。