新品項藥品支付價格之訂定原則如下：
一、同一成分劑型藥品之價格，以常用劑量為計算基準，當劑量為倍數時，其支付價格以不超過倍數之九成為原則。
二、屬藥物許可證換證之新品項：
（一）於舊證註銷日三個月以內提出建議者：得延用舊證藥品之價格。
（二）於舊證註銷日起超過三個月提出建議者：視同新品項，依本標準第四條之程序辦理。
三、建議收載之規格量，應以藥品許可證登載之「包裝種類」為限。
四、外用液劑、外用軟膏劑、口服液劑等劑型，非屬本標準已收載之規格量品項：
（一）本標準已收載同一張許可證不同規格之品項者，依個別藥品之仿單、世界衛生組織（WHO）之ATC網站之每日劑量換算給付合理天數，作為是否收載之依據，但以仿單之用法、用量為優先，其支付價格以最近似之高低規格量換算，取最低價核算。
（二）醫療必須使用之特殊規格，必要時提請臨床醫師及醫、藥專家提供專業認定。
（三）屬新複方製劑，與已收載品項無同分組者，依新藥核價程序處理。
五、授權在臺製造或販售之原開發廠藥品，如經停止授權，應依其所屬藥品分類予以重新核價。
六、全靜脈營養輸液按醫療機構提供之全靜脈營養處方箋中，所使用本標準已收載品項之用量，乘以各品項每毫升之藥價單價，加總後之藥價，再換算該全靜脈營養輸液每毫升之藥價（四捨五入至小數點第二位）核算。
七、新品項核價參考品之價格所依據之時間點，依新品項預計之生效日為準；如其參考品之價格於該時間點已有後續即將調整價格之資訊時，核算二個先後生效之支付價格。
八、屬本標準第十四條第二款第二目，且為二種有效成分以上之複方製劑之核價原則如下：
（一）新品項之單位含量組成與本標準已收載同成分劑型品項之單位含量組成，具比例關係且等於一時，依本標準第二十七條至第三十三條辦理。
（二）新品項之單位含量組成與本標準已收載同成分劑型品項之單位含量組成，具比例關係且非等於一時，取下列條件之最低價：
1.單位含量組成具比例關係之同成分劑型品項最低價，以規格量換算後價格。
2.該品項或同單位含量組成之原開發廠藥品之十國藥價最低價。
3.同單位含量之各單方藥品最低價（各單方以同廠牌藥品之健保支付價優先）合計乘以百分之七十後價格。
4.廠商建議價格。
（三）新品項之單位含量組成與已收載同成分劑型品項之單位含量組成，不具比例關係時，取下列條件之最低價：
1.該品項或同單位含量組成之原開發廠藥品之十國藥價最低價。
2.以同單位含量之各單方藥品最低價（各單方以同廠牌藥品之健保支付價優先）合計乘以百分之七十後價格。
3.廠商建議價格。
九、新品項屬成分性質或配方改變，經醫、藥專家認定與本標準已收載同成分劑型品項具相同療效者，得依該核價參考品之療程劑量及單價，核算其支付價格。
十、新品項之成分、劑型，如與已收載之罕見疾病用藥相同，但其適應症非屬罕見疾病者，其核價參考品及核價方式得經醫、藥專家建議後，提藥物擬訂會議討論，併同檢討已收載之同成分、劑型藥品。