會計室掌理歲計、會計及統計等事宜。分設四股，各股之職掌如下：
一、第一股：
(一) 歲入、歲出概 (預) 、決算之編報及預算追加、追減之辦理。
(二) 預算之分配、修正及經費之保留。
(三) 動支第一、二預備金之申請。
(四) 歲計事務之處理。
(五) 主計法規之研究、建議及改進。
(六) 其他上級交辦事項。
二、第二股：
(一) 經費類各項憑證審核、記帳憑證之編製與會計簿籍之登載、清理與
核結。
(二) 會計事務之處理。
(三) 經費類會計憑證、簿籍及會計案卷之整理、保管及送審。
(四) 經費類會計報告之編報。
(五) 各單位零用金之管制及審核。
(六) 各種代收款項之收付及審核。
(七) 財務罰鍰獎金之分配。
(八) 預算控制及經費流用。
(九) 增進財務效能，減少不經濟支出之研究及建議。
(十) 營繕工程及購置、定製、變賣財物之監辦。
(十一) 內部審核業務之執行。
(十二) 其他上級交辦事項。
三、第三股：
(一) 歲入類會計各項憑證、報表之審核及登記。
(二) 歲入類記帳憑證之編製、建檔、併檔及會計簿籍之登載、清理及核
結。
(三) 徵課會計電腦產出代傳票、明細分類帳、總分類帳報表之核對。
(四) 歲入類會計憑證、簿籍、報表之裝訂、整理、保管及送審。
(五) 各項稅課收入退還書及退稅支票之審核與簽發。
(六) 歲入類會計報告之編報。
(七) 各項違章案件財務罰鍰提成之分配。
(八) 其他上級交辦事項。
四、第四股：
(一) 國稅收入之調查、統計及分析。
(二) 公務統計報表之編製。
(三) 年度統計資料之核編、發佈及供應。
(四) 各項國稅徵課實況報表之編報。
(五) 本室會統人員之任免、遷調、獎懲、考核事項之處理及建議。
(六) 其他上級交辦事項。

局長綜理局務，其權責如下：
一、本局工作計畫、工作報告編擬之指示及決定。
二、本局概算編製與預算分配之指示及決定。
三、本局各項稽徵稅目預算執行之監督。
四、本局業務之分配、調整及改進。
五、本局各單位及所屬機關各級人員之任免、遷調、獎懲與考核。
六、本局各單位及所屬機關工作之監督、指導及考核。
七、本局各項課稅適用法令、規章重要原則之指示採擇。
八、本局重要公文、文稿之批閱及核判。
九、重要稅務案件變更處理方式之決定。
十、重要會議之主持及參加與紀錄之核定，暨其他非由其主持之重要會議
紀錄之核定。
十一、財政部部、次長交辦事項。
十二、其他有關重要業務、事務之處理。

副局長襄理局務，其權責如下：
一、重要業務及工作計畫之參與決定。
二、重要文稿、文件之核閱。
三、局長不在局時局務之代理。
四、本局甄審委員會及考績委員會之主持。
五、各種會議局長不出席時之主持。
六、各種會議之參加或代表局長出席。
七、各單位職掌分配調整之建議。
八、隨時提請局長注意之重要事項。
九、局長特交事項。
十、其他有關業務之贊襄。

主任秘書權責如下：
一、文稿、文件之核閱。
二、重要機密文件之處理及分配。
三、各單位工作推進之配合聯繫。
四、本局工作計畫及工作報告之彙編。
五、各科、室間權責爭議之協調。
六、重要會議之參加。
七、職責上應呈報局長之重要事項。
八、局長、副局長交辦事項。

科長、室主任各承局長、副局長之命 (監察室主任、會計室主任、人事室
主任、政風室主任，並受上級會計、人事、政風、調查機構之監督) 綜理
本科、室業務，其權責如下：
一、本科、室主管案件之分配與文稿之審核。
二、本科、室業務及工作計畫之簽擬及工作計畫進度之考核。
三、依照本局處理公務分層負責明細表之規定，本科、室主管決行事項之
核定。
四、本科、室主管業務範圍內有關法令之擬訂及解釋。
五、本科、室各級職員考核、獎懲之簽擬。
六、本科、室人員工作之調派及指揮、監督與日常事務之處理。
七、職責上應呈報局長之重要事項。
八、其他交辦事項。

股長分承各該科長、室主任之命處理公務。其權責如下：
一、本股主管案件之分配、審查及初核。
二、本股主管業務之分配及指導。
三、本股職員平時及年終考績之提供意見。
四、本股職員工作調派及指揮、監督與日常事務之處理。
五、本股主管業務範圍內有關法令之解釋及答覆。
六、其他交辦事項。

秘書、稽核、督導、分析師、審核員、專員、設計師、管理師、稅務員、
科員、助理員、書記等人員，各承長官之命，依法辦理主辦事項。