查獲之毒品合於醫藥用者，衛生福利部食品藥物管理署認有必要時，得由該署製藥工廠向法務部申請，經核准領用後，除本辦法之規定外，其管理適用管制藥品管理條例之規定。

查獲之毒品或器具合於研究或訓練用者，領有管制藥品登記證之機關（構），得向法務部申請領用。

查獲之毒品含有新興毒品或成分而有製成標準品之需者，衛生福利部或其他政府機關依法設置之檢驗機關（構），得向法務部申請領用部分檢體，製成標準品使用或供其他檢驗機關（構）使用，經核准領用後，其屬管制藥品者，除本辦法之規定外，其管理適用管制藥品管理條例之規定。

前三項申請領用毒品或器具之機關（構），應檢具申請書（如附件一）載明領用毒品或器具之數量，附相關證明文件及計畫書，向法務部提出申請；經核准後，依核准文件向保管機關領用。

依第三項領用而製成之標準品，應經其他公正機關（構）確認後，始得作為檢驗毒品使用。

其他毒品檢驗機關（構）如有檢驗新興毒品之需求，得檢具申請書（如附件二）向法務部申請經前項確認之標準品使用。

外國機關（構）需使用毒品研究者，應與本國機關（構）合作，由本國機關（構）依前條第二項及第三項規定申領後遞交。

前項外國機關（構）管制、使用、剩餘毒品處理情形及研究結果，應以正式公文書告知本國申領機關（構）陳報法務部。

領用機關（構）應將領用之毒品或器具嚴密管制，並依計畫書及相關規定使用。

領用機關（構）應將毒品或器具之使用結果陳報法務部；未用罄之毒品或無續行使用必要之器具，應檢還原保管機關，並副知法務部。

保管機關應就每一裁判確定案件所扣押逾一公斤之毒品及器具，按月於該機關網站公告之，俾供有關機關（構）申請領用；各該案件經公告後一個月內無機關（構）申請領用者，依法銷燬之。

尚未裁判確定案件所扣押逾一公斤之毒品及其器具有腐敗、喪失、毀損之虞或因追查毒品來源地之急迫需要者，得經該案件承辦檢察官或法官書面同意後，依第三條及第四條之規定申請領用。

前項之毒品於裁判確定前，如偵查中經檢察官處分命令或審理中經法院裁定銷燬，保管機關於銷燬前應於該機關網站公告之，俾供有關機關（構）申請領用；各該案件經公告後一個月內無機關（構）申請領用者，依法銷燬之。保管機關於偵查中公告者，公告內容應先經承辦檢察官同意，並注意偵查不公開作業辦法之相關規定。