補償金種類分為醫療補償金、失能補償金及死亡補償金。醫療補償金指收容人因就醫而自付金額，但不包含自費項目。

收容人因作業或職業訓練致死亡者，發給死亡補償金新臺幣（以下同）一百萬元；致失能者，發給失能補償金最高金額不得逾四十五萬元，依勞工保險失能給付標準之等級給付之；致重傷者，發給醫療補償金最高金額不得逾三十萬元；致受傷或罹病者，發給醫療補償金最高金額不得逾二十萬元。

前項有二種以上情形者，得合併發給之。

醫療補償金應檢具下列文件向原執行機關申請，由機關作業基金業務外費用項下支付：

申請失能或死亡補償金應由機關檢具下列文件報請法務部矯正機關作業基金管理會核准後發給：

前項申請報告表應敘明失能或死亡原因及處理情形。

補償金應由收容人本人或最近親屬領受，死亡者機關應通知繼承人領受，無法通知者，應公告之。

前項補償金之發給，經受通知人拋棄或通知後逾六個月或公告後逾一年無人領受者，歸入作業基金。

補償金由最近親屬領受時，應按收容人之配偶、直系血親卑親屬、父母、兄弟姊妹、祖父母之順序發給之。

意外事故係因收容人故意所致者，不予發給補償金；因重大過失所致者，減發百分之五十。

故意或重大過失認定，由監督機關依事實調查或依有關機關之鑑定報告辦理。

有下列情形之一者，應自補償金中減除之：

前項若有二款以上者，合併減除之。