本條例第五條第三項所稱新市鎮計畫範圍內之保護區土地逾二十年未開發使用者，指新市鎮特定區計畫範圍內之保護區土地，自新市鎮特定區計畫發布實施日起逾二十年，未檢討變更為都市發展用地，進行開發建設者。

私人或團體申請開發前項保護區土地之許可條件、辦理程序及應備書件等事項，由中央主管機關或其指定直轄市、縣（市）主管機關定之。

原土地所有權人依本條例第八條第二項規定，申請由開發主管機關統籌興建建築物後分配時，開發主管機關得興建建築物或就拆遷安置原住戶住宅之剩餘住宅予以分配，其作業要點由開發主管機關定之。

開發主管機關未能依本條例第八條第二項規定統籌興建建築物分配時，應通知原土地所有權人改依同條項規定申請合併或自行出售。

本條例第八條第四項所稱開發總成本，指徵收私有土地之現金補償地價或協議價購地價、有償撥用公有土地地價、公共工程費用、土地整理費用及貸款利息等項之支出總額。

前項所定公共工程費用，包括道路、橋樑、溝渠、地下管道、公園、綠地、廣場、停車場、兒童遊樂場、體育場及其他經主管機關核定設施之規劃設計費、整地費、施工費、材料費及管理維護費。所定土地整理費用，包括土地改良物或墳墓拆遷補償費、動力及機械設備或人口搬遷補助費、營業損失補助費、自動拆遷獎勵金、加成補償金、地籍整理費、救濟金及辦理土地整理必要之業務費。

開發主管機關或管轄稽徵機關對申請適用本條例獎勵或租稅減免規定之案件，未於法令所定期限內為准否之處分者，自期限屆滿之次日起，申請者得就其請求事件，向其上級機關申請查復處理情形。

上級機關接獲前項申請案後，應即指示所屬機關限期處理。必要時，得向所屬機關調閱卷宗，並追究所屬機關之遲延責任。

第一項申請案件欠缺法令規定事項而可以補正者，開發主管機關或管轄稽徵機關應限期通知申請者補正，逾期不為補正者，應為駁回之處分。

前項可以補正之事項，應就全案一次通知申請者補正。

本條例第二十五條第一項所定新市鎮特定區內建築物興建完成後，其房屋稅及買賣契稅之減免，指本條例公布施行後新市鎮特定區內興建完成之建築物，於核發使用執照當日起，五年內房屋稅及買賣契稅之減免；其地價稅之減免，指本條例公布施行後新市鎮特定區內興建完成之建築物，於核發使用執照當日所屬之徵收期間起，五年內地價稅之減免。

本條例第二十五條第二項所定減免買賣契稅以一次為限，係指建築物興建完成後第一次買賣移轉契稅之減免。

新市鎮特定區主管建築機關核發建築物使用執照時，應註明新市鎮特定區建築物字樣。其稅捐之減免，應由納稅義務人檢具建築物使用執照影本及相關證明文件，向土地或建築物所在地之主管稽徵機關申請。

依本條例第二十六條第一項規定，由開發主管機關編列預算支應之新市鎮開發規劃設計經費項目如下：

前項各款規劃設計經費，開發主管機關未及編列預算支應時，得洽由中央主管機關指定新市鎮開發基金先行墊支，再由開發主管機關編列預算歸墊。