本處處長綜理處務，副處長襄理處務並設左列各課、室、管理站及人事管
理員、會計員：
一、企劃經理課。
二、工務建設課。
三、觀光遊憩課。
四、保育研究課。
五、解說教育課。
六、秘書室。
七、人事管理員。
八、會計員。
九、各管理站。

保育研究課之職掌如左：
一、關於本區域內自然資源之保育、研究、監督事項。
二、關於本區域內人文史蹟資料之蒐集、研究與管理事項。
三、關於本區域內各種標本之採集製作、標示研究與保管事項。
四、關於本區域內瀕臨滅絕及稀有之野生動物、植物復育計畫執行事項。
五、關於本區域內生態保護區之經營、管理事項及其保育計畫之研擬與實
施事項。
六、關於本區域內違法盜採、盜獵、盜伐等危害毀損自然資源及人文資源
行為之處理復舊與監督事項。
七、關於保育研究案實施計畫之研擬及執行與推廣事項。
八、其他有關保育研究事項。

管理站之職掌如左：
一、站區域內遊憩服務、宣導解說及安全維護管理事項。
二、站區域內各項公共設施之維護、管理事項。
三、站區域內有關急難之救助事項。
四、站區域內自然資源之維護、研究及保育事項。
五、站區域內之環境清潔事項。
六、其他有關站區域內及鄰近地區之管理事項。