本處處長綜理處務，副處長襄理處務並設左列各課、室及人事、會計人員
：
一、企劃經理課。
二、工務建設課。
三、觀光遊憩課。
四、保育研究課。
五、解說教育課。
六、秘書室。
七、人事管理員。
八、會計員。

保育研究課之職掌如左：
一、關於本區域內自然資源之保育研究、經營及其執行、監督事項。
二、關於本區域內人文資料之蒐集、研究與管理事項。
三、關於本區域內各種標本之採集製作、標示研究與保管事項。
四、關於本區域內保育研究成果之應用與推廣事項。
五、關於本區域內危害毀損自然資源及人文資料行為之處理與監督事項。
六、其他有關保育研究事項。