一、第一科：智慧財產權相關組織之資料交流、聯繫與合作，智慧財產權圖書與資料蒐集、採購與管理，本局與圖書資訊館際協會之合作相關事項，我國專利英文資料庫之建置及其他有關事項。

二、第二科：智慧財產權資料之研究、業務統計及分析事項，智慧財產權相關資料及公報之編譯、出版、發行及其他有關事項。

三、第三科：智慧財產權相關資料之管理運用及自動化之應用，智慧財產權媒體應用，各服務處業務之協調、聯繫、督導及管理，專利商品化活動相關事項，智慧財產權資料之整理、公共閱覽、資料服務及推廣事項。

秘書室置室主任一人，分五科辦事，其掌理事項如下：

一、第一科：國會聯絡、公共關係及新聞聯繫與發布及其他有關事項。

二、第二科：公文之收發、分辦、繕校、稽催及印信之典守及其他有關事項。

三、第三科：出納管理、財產管理、物品採購、辦公處所及宿舍維修、工友管理、環境整理維護、車輛之調度維護、會議場所之服務管理及其他有關事項。

四、第四科：檔案管理及其他有關事項。

五、第五科：本局機要公文之處理、保管及局長、副局長、主任秘書之秘書管理及其他有關事項。

會計室置會計主任一人，分二科辦事，其掌理事項如下：

一、第一科：歲出、歲入傳票及付款憑單之開製，各項會計報告、半年結算、決算等之編報，會計簿籍之處理及原始憑證之整理、保管與送審，暫收（付）款、保管款之清理，銀行及支付處收支對帳會核，各項收入之審核，經費流用與保留之申請，庫存現金、有價證券、財物抽查與帳目核對事項，本室綜合業務事項。

二、第二科：年度歲入、歲出預（概）算之籌編及分配預算之編製，預算之執行、控制，原始憑證之審核，採購案件之審核、監辦，預備金之動支，財務上增進效能及減少不經濟支出之建議事項，公務統計事項，會計人事之辦理。

各單位辦公需要所未預備之物品等，依本局採購作業方式及金額授權分級表規定辦理。