徵集組職掌如下：
一、關於全般兵源政策計畫之研擬、規劃事項。
二、關於兵役徵集法規之研擬、修正、解釋事項。
三、關於各級地方政府應辦徵集處理及延期徵集業務之策劃、督導事項。
四、關於役男兵籍調查、免役、禁役、緩徵、服補充兵之規劃、督導事項
。
五、關於役男服常備兵役年度員額配賦、抽籤、徵集、入營輸送之規劃、
督導事項。
六、關於預備軍官考選及徵訓之協調事項。
七、關於僑民 (生) 、香港、澳門、大陸來臺役男服役事項。
八、關於接近役齡男子及役男出境、換發護照事項。
九、關於役男入營座談會、懇親會、新訓中心參訪之規劃、督導事項。
十、關於役男徵兵檢查之規劃、督導事項。
十一、關於體位區分標準及役男體複檢相關法令之研擬、修正、解釋事項
。
十二、關於役男體位判等、申請改判體位、驗退處理之規劃、督導及審查
事項。
十三、關於替代役役男驗退及因病停役處理之規劃、督導事項。
十四、關於役男體位審查委員會運作及役男申請改判體位、驗退疑義處理
等事項。
十五、關於檢查醫院、複檢醫院之指定、協調、爭議處理及考核事項。
十六、其他有關徵集作業事項。
甄訓組職掌如下：
一、關於替代役甄訓相關法令之研擬、修正、解釋事項。
二、關於替代役審議委員會之綜合事項。
三、關於替代役提前退役業務之處理等事項。
四、關於各需用機關替代役年度及四年需求調查評估事項。
五、關於替代役意願調查、申請、徵集、輸送、甄選、分發之規劃、督導
事項。
六、關於各種役政及替代役訓練計畫之擬訂、規劃、督導事項。
七、關於替代役役男軍事基礎訓練、專業、在職訓練之推動事項。
八、關於替代役師資培訓、儲備之推展事項。
九、關於替代役訓練經費、教材、表報及成果之規劃、督導事項。
十、其他有關甄訓業務之事項。
管理組職掌如下：
一、關於替代役服勤管理法令之研擬、修正、解釋等事項。
二、關於各種役政及替代役業務之參訪、督考與年度評比及年終檢討會等
事項。
三、關於妨害兵役、替代役申訴、徵兵處理與因案停役等案件之調查及處
理事項。
四、關於維護役政風紀之規劃、督導事項。
五、關於替代役役男服勤管理之規劃、督導事項。
六、關於替代役役男重大事故通報及爭議之處理事項。
七、關於各需用機關服勤管理要點審核事項。
八、關於替代役役男請假、獎懲法規增修事項。
九、關於替代役役男服役期間輔導教育及獎懲辦理事項。
十、關於替代役役男生活管理之督導事項。
十一、其他有關管理業務事項。
權益組職掌如下：
一、關於常備役及替代役服役役男權益法令之研擬、修正、解釋等事項。
二、關於常備役及替代役役男留守、復職、慰勞業務之規劃、督導事項。
三、關於常備役及替代役役男優待及扶 (慰) 助業務之規劃、督導事項。
四、關於替代役役男醫療、就診規劃、督導事項。
五、關於替代役役男一般保險、全民健康保險、團體意外保險之研擬、規
劃、督導事項。
六、關於替代役撫卹案件之規劃、督導事項。
七、關於常備役及替代役役男傷殘慰助金、安養津貼之規劃、督導事項。
八、關於傷殘鑑定之指定醫院協調、爭議處理事項。
九、關於替代役安全濟助基金之規劃、督導事項。
十、死亡軍人及替代役役男因公死亡者之安葬、紀念、祭祀之規劃、督導
事項。
十一、關於地方軍人公墓 (忠靈祠) 之規劃、督導事項。
十二、關於替代役役男、薪俸、地域加給、主副食費與年終工作獎金之發
放及相關法規之研擬、修正、解釋等事項。
十三、關於替代役需用機關役男經理物品之策劃、採購、補給、保管、維
護等事項。
十四、關於配合支援相關替代役非常事變之後勤事項。
十五、其他有關權益事項。
召集組職掌如下：
一、關於替代役役男役籍、編管、召集及役政資訊相關法令之研擬、修正
、解釋事項。
二、關於替代役役男平時演訓事項。
三、關於替代役役男役籍管理之規劃及督導事項。
四、關於替代役役男身分證、服役期滿退役之核定與證書製發及管理、督
導事項。
五、關於替代役役男因案、因病、停役之回役處理事項。
六、關於常備役役男退伍、歸休、復員、解除召集、輔導就業之規劃、督
導事項。
七、關於後備軍人緩、逐、儘召及動員、臨時召集之督導協調事項。
八、關於後備軍人及替代役役男服役後之管理事項。
九、關於直轄市、縣 (市) 政府有關替代役輔助勤務編組之作業、督導事
項。
十、關於國民兵管理、兵役協 (分) 會案件處理事宜之規劃、督導事項。
十一、關於年度非常事變時替代役輔助勤務召集準備計畫之規劃、督導事
項。
十二、關於一般申請替代役召集服勤之核定及緊急申請召集之核備事項。
十三、關於直轄市、縣 (市) 政府替代役編組及作業之協調、督導事項。
十四、關於軍事人力分配運用及人口政策之協調事項。
十五、關於災害防救緊急應變業務事項。
十六、關於役政資訊化作業之規劃、處理、管理及考核事項。
十七、關於役政資訊網路監控管理與系統規範及系統更新之規劃事項。
十八、關於本署資訊系統規劃、處理、管理及考核事項。
十九、其他有關召集與資訊及役籍管理事項。