申請基因改造飼料或飼料添加物許可，除第二項另有規定外，依下列規定收費：
一、審查、安全性評估及發給許可證明文件：每件二十五萬元。
二、基因改造動物或植物飼料或飼料添加物之檢驗：每件四十萬元。
三、基因改造微生物飼料或飼料添加物之檢驗：每件二十二萬元。
四、展延、變更、換發、補發證明文件：每件六千元。
基因改造飼料或飼料添加物有下列情形之一者，依基因改造之黃豆及玉米查驗登記審查費鑑別檢驗費收費表收費，不適用前項規定：
一、於飼料管理法第十一條之一第四項所定辦法（以下簡稱基因改造辦法）發布施行前，依食品安全衛生管理法第二十一條第二項申請（以下簡稱查驗登記），經中央衛生主管機關發給許可文件（以下簡稱基因改造許可文件）。
二、於基因改造辦法發布施行前，已申請查驗登記，且於基因改造辦法發布施行後，取得基因改造許可證明文件。