本會之任務如左：
一、關於建立臺灣地區醫療資訊網政策之研擬及規劃事項。
二、關於建立臺灣地區各醫療區域醫療資訊網實施計畫之研議事項。
三、關於臺灣地區各醫療區域資訊設備配置及應用系統規劃之審核事項。
四、關於醫療資訊網計畫相關法令規章之研議事項。
五、關於協調其他機構配合推動醫療資訊網計畫之研議事項。
六、關於醫療資訊網資訊系統執行之督導及考核事項。
七、關於醫療資訊網計晝執行成果評估之研議事項。
八、其他有關建立臺灣地區醫療資訊網之研議事項。