本局第三組職掌如左：
一、水文、海洋、漁業等氣象業務之規劃及推行事項。
二、水文、海洋、漁業等氣象資料之蒐集、編輯、出版、提供等事項。
三、國內外水文及海洋氣象業務之聯繫及合作事項。
四、氣象資料處理之規劃、督導、考核等事項。
五、氣象資料之蒐集、統計、編篡、管理、供應等事項。
六、航空氣象業務之協調及聯繫事項。
七、農業氣象業務之規劃、推行、督導、考核等事項。
八、有關農業氣象資料之蒐集、編輯、出版、提供等事項。
九、農業機構之協調合作及農業氣象之推展有關事項。
十、一般及專業氣象服務之諮詢、協調、推動、督導事項。
十一、氣象展覽會之委劃及聯繫事項。
十二、其他交辦事項。