業務組掌理事項如下：
一、國道公路建設管理基金財務計畫之研擬及修正；長短期資金之收支、運用、籌措、償還之管理及審議。
二、收費策略、規章之訂修、研擬、督導及考核；通行費率之調整研擬。
三、電子收費技術發展及委辦業務之履約管理。
四、通行量之彙計分析；通行費帳務、逃欠費及金流之稽核管理。
五、收費業務年度概算之編審。
六、服務區營運管理作業規章訂修之研擬；服務區、加油站委外營運之管理及督導。
七、違規舉發作業、申訴、訴願、法院聲明異議、抗告及訴訟案件之處理。
八、規費強制執行標的之查證取得、憑證管理、統計結案數及金額分配簽結。
九、車（戶）籍資料查詢系統之介接管理及查詢費用之清算。
十、其他有關國道收費及服務區營運業務事項。