秘書室除掌理審核文稿及機要事項外，另分三科辦事，其職掌如左：
一、第一科掌本局施政計畫、業務報告、局務會議、研究發展及管制考核
、公共關係、便民服務、大事彙記、一般外文函件處理、綜合業務及
不屬於其他各組處室事項。
二、第二科掌總收文、分文、繕校、印信、總發文、檔案及其他有關文書
管理事項。
三、第三科掌物品購置及修繕、財產管理、車輛及油料管理、辦公處所管
理、宿舍管理、工友管理、會場管理、防護管理、出納及其他有關事
務管理事項。