財團法人有下列情形之一者，本部得予糾正並責令其限改善；逾期不改善或改善無成效且情節重大者，除依第二十四條規定辦理外，並得撤銷其許可：
一、未依營運計畫執行業務或經營核准登記範圍以外之業務者。
二、董事會之決議違法或不當者。
三、財政收支未具合法之憑證或未有完備之會計紀錄者。
四、對於業務、財務為不實之報告者。
五、捐助人或遺囑執行人不依第九條所定期限將財產移轉予財團法人者。
六、違反第十八條法院登記財產總額之不動產處分。
七、業務及財務報表未依限或其內容未依規定編送本部查核者。
八、經費收支無詳實之記載，或不保存收支之會計憑證致無法查核者。
九、隱匿財產或妨礙本部之檢查者。
十、以法院登記財產總額及其孳息、業務所得及其他收入而為非法或不正當之支出或開支浮濫者。
十一、無正當理由未從事其業務活動達二年。
十二、於年度中虧損達上年度財團法人淨值總額二分之一，或累積虧損達法院登記財產總額二分之一，致其運作不能達設立目的者。
十三、其他違反本準則、捐助章程或遺囑之規定者。
財團法人經本部依前項規定撤銷其許可者，本部應同時依民法第四十二條第二項規定通知法院，由法院命令財團法人進行解散登記及清算，並副知財團法人所在地稅捐稽徵機關。