海關為應外界需求，在不妨礙公務下，調撥人力及電腦機時，提供報表、光碟、報關等資訊服務，應徵收資訊特別服務費。
資訊特別服務費之計算，按下列各款規定分別計列加總：
一、程式設計︰
除使用系統之公用程式（UTILITY） 及現有程式，無需設計人力不予計費外，應按實際投入設計人力，其計費公式：
平均月薪×Ｒ×１．３×（１＋Ｍ／１００）×（１＋Ｎ／１００）
Ｒ＝（１２＋年終獎金月數）／１２
Ｍ＝管理費用比例
Ｎ＝公費比例
其相關值為：Ｍ＝８０，Ｎ＝２０
二、使用資源：
（一）通關資料按月計費，不足一個月者以月計算。
1.線上作業：每月新臺幣二百五十元。
2.非線上作業：每月新臺幣一千元。
（二）非通關資料按件計費，每件新臺幣二千元。
三、以電腦列印報單：每份徵收新臺幣一百元。
四、定價外售貿易統計光碟之收費標準：
（一）一至三月，每月新臺幣八千元。
（二）四至六月，每月新臺幣九千元。
（三）七至九月，每月新臺幣一萬元。
（四）十至十二月，每月新臺幣一萬一千元。
前項費用除第三款及第四款外，應按次合計加總，其每次加總金額未滿新臺幣二千元者，按基本費用新臺幣二千元徵收資訊特別服務費。
採用海關網際網路報關系統辦理報關者，徵收每份報單新臺幣三十五元使用費，其實施日期，由財政部另行公告之。