會計室掌理歲計、會計事項，並兼辦統計事項。分設三股，各股之職掌如
左：
一、第一股：
(一) 本局及所屬分、支局歲入預算之控管。
(二) 歲入類原始憑證之審核。
(三) 歲入類記帳憑證之造具。
(四) 歲入類會計簿籍之登載。
(五) 歲入類會計報表之編造。
(六) 歲入類會計檔卷之整理及保管。
(七) 有關徵課會計制度之研擬及推行。
(八) 其他有關歲入會計事項。
(九) 兼辦一般公務統計事項。
二、第二股：
(一) 本局及所屬分、支局歲出預算之控管。
(二) 經費類原始憑證之審核。
(三) 經費類記帳憑證之造具。
(四) 經費類會計簿籍之登載。
(五) 經費類會計報表之編造。
(六) 經費類會計檔卷之整理及保管。
(七) 其他有關歲出會計事項。
三、第三股：
(一) 本局及所屬分、支局歲出、入概算之彙編。
(二) 本局及所屬分、支局預算執行之監督及審核。
(三) 會計憑證之事後查核及送審。
(四) 有關現金、有價證券、保管品及財產物品之檢查。
(五) 營繕工程、財物購置、定製、變賣之監辦及相關合約會簽。
(六) 財產統制帳之登載及處理。
(七) 內部檢查之執行。
(八) 有關本室人事、文書、庶務等行政事項。