審查三科掌理貨物稅、菸酒稅、證券交易稅、期貨交易稅之調查、稽徵，
違章檢舉之查緝及專案調查等事宜。分設三股，各股之職掌如下：
一、貨物菸酒證交稅股：
（一）加強貨物稅及菸酒稅稽徵及防止逃漏查緝工作計畫之擬訂及執行。
（二）貨物稅及菸酒稅選案查核計畫之擬訂及執行。
（三）貨物稅專案查核之規劃及執行。
（四）貨物稅及菸酒稅法令疑義之請釋及解答。
（五）貨物稅飲料品免稅蔬果汁抽樣化驗作業之擬訂及執行。
（六）廠商申請或停止實施以出（送）貨單或出廠證代替貨物稅完稅照案
件之核轉。
（七）廠商申請以電子計算機開立專用完稅照案件轉陳財政部核准。
（八）貨物稅及菸酒稅各項月報及統計報表之編造、彙報。
（九）貨物稅申報書表、各項證照之規劃及統籌印製。
（十）貨物稅及菸酒稅稽徵作業手冊之編（修）訂。
（十一）分局、稽徵所貨物稅及菸酒稅稽徵業務之督導及考核。
（十二）貨物稅及菸酒稅申報與納稅實務座談會及各項講習會之規劃。
（十三）外轄廠商違章案件之通報。
（十四）海關辦理出口報單副本簽證人員印鑑卡之通報。
（十五）貨物稅及菸酒稅檢舉案件之調查核定。
（十六）菸酒廠商申報納稅書表之查核及保管。
（十七）菸酒稅申報書表之統籌印製。
（十八）藥酒廠商之實地稽查。
（十九）其他有關貨物稅及菸酒稅行政事項之處理。
（二十）證券交易稅專業代徵及一般代徵稅額繳款書報核聯之審查。
（二十一）證券商及期貨商代徵證券交易稅及期貨交易稅業務之查核。
（二十二）未上市證券發行公司股票讓受資料之調查及處理。
（二十三）證券交易稅及期貨交易稅代徵獎金之核發。
（二十四）證券交易稅及期貨交易稅更正退稅案件之審查。
（二十五）證券交易稅及期貨交易稅違章案件之移罰。
（二十六）證券交易稅及期貨交易稅法令疑義之請釋及解答。
（二十七）證券商、未上市證券發行公司及期貨商訪查計畫之擬訂及執行
。
（二十八）其他有關證券交易稅及期貨交易稅行政事項之處理。
二、查緝一股、二股：
（一）年度查緝作業計畫之擬訂及執行。
（二）檢舉密告案件之查緝及會審。
（三）有關單位或機關通報違章案件之查緝。
（四）主動蒐集違漏資料、追查案件之查緝。
（五）違漏案件顯涉刑事責任且需擴大追查案件之處理。
（六）分局、稽徵所受理檢舉違章漏稅案件處理之督導。
（七）巨額結購外匯案件之查緝。
（八）其他有關檢舉及查緝行政事項之處理。