稅務資訊科掌理本局資料管理及電作資訊業務。分設六股，各股之職掌如
下：
一、整理股
（一）綜合所得稅之非扣繳所得資料（包含執行業務類、其他類之補習班
、幼稚園、托兒所）之蒐集、整理、釐正、標符、移送建檔、掃描
。
（二）受理一時貿易所得資料之申報收件及資料整理、移送建檔、掃瞄。
（三）受理多層次傳銷事業參加人進貨資料之申報收件及資料整理、釐正
、標符、移送建檔。
（四）受理緩課股票轉讓資料（含營利、薪資）之申報收件及資料整理、
移送建檔，辦理更正註銷。
（五）受理股東投資抵減稅額證明書資料之申報收件及資料整理、移送建
檔。
（六）綜合所得稅之人工歸戶課稅資料彙整、登記、通報歸課及管制。
（七）營利事業所得稅課稅資料（含違章資料）之蒐集、整理、釐正、標
符、移送建檔、裝袋提供審查單位運用，並管制查核運用情形。
（八）分局、稽徵所移送「執行業務所得扣免繳憑單」之收件、登記、移
送建檔及掃描。
（九）配合各單位需求，提供各項課稅資料之查詢。
（十）營業稅課稅資料之蒐集、整理、釐正、標符、移送建檔。
（十一）原始資料點收、登錄之執行及管制。
（十二）各種原始憑證輸出清單核對更正及退查。
（十三）產出表報之查點、移送及回報管制。
（十四）配合業務單位提供各項建檔資料查詢。
（十五）課稅資料（含繳款書）之外包登錄連繫、異常查對、核驗及驗收
。
（十六）繳款書報核聯之整理、統計及分送作業。
（十七）營業稅進銷項媒體及網路申報異常資料通知與更正作業。
（十八）其他上級交辦事項。
二、保管股
（一）各稅空白單照之申領、管理及核發。
（二）課稅資料保管計畫之訂定。
（三）遺產稅、贈與稅、營利事業所得稅、執行業務所得等申報核定案卷
之保管、整理、調借及調還案稽催管理。
（四）綜合所得稅影像查調作業之規劃及執行。
（五）課稅資料逾保管期限計畫之訂定。
（六）執行業務所得及各類非扣繳所得課稅資料之保管。
（七）營利事業所得稅結算申報及未分配盈餘申報案件更正（已入庫保管
未核定案件）。
（八）申報核定案卷查詢。
（九）課稅案卷及原始資料提供、運用作業：
1.本局內部自行使用之各類所得課稅資料查調提供。
2.受理機關團體查調財產、遺產稅、贈與稅、營利事業所得稅、執
行業務所得、綜合所得稅、扣繳、非扣繳各類所得申報、核定資
料。
3.受理納稅義務人遺產稅、贈與稅、營利事業所得稅、執行業務所
得申報核定案卷之影本資料提供（臨櫃申辦或離櫃掛文申辦或網
路申辦）。
4.受理納稅義務人遺產稅、贈與稅、營利事業所得稅、綜合所得稅
執行業務所得卷宗閱覽、抄寫、複印、攝影（臨櫃申辦或離櫃掛
文申辦或網路申辦）。
（十）電腦逕核案件之核定通知書裝袋整理。
（十一）其他上級交辦事項。
三、系統一股
（一）開發設計電作資訊系統。
（二）執行維護各項應用系統、網路系統。
（三）各項作業進度之擬訂、管制及檢討。
（四）資訊相關行政之規劃、執行、管制。
（五）應用系統上線輔導，系統問題聯繫、協調、解決。
（六）自動化作業手冊編撰及維護。
（七）單位內部自行查核計畫之擬訂、管制及執行成果陳報。
（八）其他上級交辦事項。
四、系統二股
（一）開發設計電作資訊系統。
（二）執行維護各項應用系統、網路系統。
（三）各項作業進度之擬訂、管制及檢討。
（四）資訊相關行政之規劃、執行、管制。
（五）應用系統上線輔導，系統問題聯繫、協調、解決。
（六）自動化作業手冊編撰及維護。
（七）其他上級交辦事項。
五、系統三股
（一）開發設計電作資訊系統。
（二）執行維護各項應用系統、網路系統。
（三）各項作業進度之擬訂、管制及檢討。
（四）資訊相關行政之規劃、執行、管制。
（五）應用系統上線輔導，系統問題聯繫、協調、解決。
（六）自動化作業手冊編撰及維護。
（七）稽徵業務考核（自動化作業）之規劃與執行。
（八）資訊教育訓練辦理、行事曆管制、操作文書之管理。
（九）其他上級交辦事項。
六、機器操作股
（一）電腦及週邊設備之新增、更換計畫之訂定及經費預算之評估。
（二）電腦設備及耗材之請購及管理。
（三）使用媒體檔案之配置、保管、備援及管理。
（四）程式館進改館及操作文書管理。
（五）主機機時之安排，使用機時之統計分析及機器操作疑難問題之處理
。
（六）電腦及通訊設備之租購、安裝運轉及維護。
（七）資料庫系統管理。
（八）災變模擬計畫之擬訂及回復之演練。
（九）配合各單位之需求，產出各項資訊。
（十）機房門禁管理及作業環境之維護。
（十一）電腦套裝軟體之清查與管理。
（十二）其他上級交辦事項。