船務科職掌如下：
一、船艇建造之規劃及執行事項。
二、船艇管理與維修工作之規劃、執行、督導及考核事項。
三、船艇定保、歲修、海損、航修、一、二級自力維保之規劃、執行及考
核事項。
四、船舶、航儀研究發展、通信之規劃及督導事項。
五、通信設備及其維修工作之規劃、執行、督導及考核事項。
六、無線電通訊系統頻率、諸元之申請、律定與通訊紀律之規劃、執行及
督考事項。
七、其他有關船務業事項。