捕撈漁船及運搬船從事漁獲物轉載前，應分別向主管機關申請許可。
經營者或船長為前項之申請時，應填具漁船轉載漁獲申報表，依下列所定期限，向主管機關提出；鮪延繩釣漁船之申報表格式如附件二十、附件二十一，鰹鮪圍網漁船之申報表格式如附件二十二：
一、海上轉載：最遲於預定轉載日前三個工作日。
二、港內轉載：最遲於預定轉載日前三日。申請日之末日為例假日時，應提前於例假日前一工作日提出。
經主管機關許可轉載之漁船及運搬船，得於下列期間從事漁獲物轉載：
一、海上轉載：許可轉載之日起算四日內。
二、港內轉載：許可轉載之日起算七日內。但轉載地點為前鎮、小港臨海新村或東港鹽埔漁港之一者，得於許可轉載之日起算十一日內。
有下列情形之一者，經營者或船長得於轉載期間屆滿前申請變更轉載日期，並經主管機關同意變更後始得為之；未於轉載期間屆滿前申請變更者，不予同意：
一、未能於前項所定期間進行轉載。
二、海上轉載預定地點變更超過二十四浬。