輔導處分設四科，各科掌理下列事項：
一、農民組織科：
（一）農會法與其子法規之擬訂及解釋事項。
（二）農會輔導政策之擬訂、策劃及督導事項。
（三）農會會員資格之擬訂、策劃及督導事項。
（四）農會選舉罷免之擬訂、策劃及督導事項。
（五）農會總幹事遴選之擬訂、策劃及督導事項。
（六）農會人事管理之擬訂、策劃及督導事項。
（七）農會財務輔導與檢核之擬訂、策劃及督導事項。
（八）農會考核之擬訂、策劃及督導事項。
（九）農會出資或投資與共同經營之擬訂、策劃及督導事項。
（十）農會經濟事業之輔導及監督事項。
（十一）農會振興計畫之策劃及輔導事項。
（十二）臺灣省農會之輔導及監督事項。
（十三）其他有關農民組織事項。
二、農業推廣科：
（一）農業推廣政策、法規之擬訂、策劃及監督事項。
（二）農業人力政策之研擬及配合事項。
（三）農業推廣機關（構）辦理農業推廣業務之輔導、監督及獎勵事項。
（四）農業推廣人員培訓之策劃及督導事項。
（五）農業推廣教育之策劃、協調及配合事項。
（六）農業推廣資訊與傳播之策劃、協調及督導事項。
（七）農村青少年推廣教育與農民終身學習之策劃、協調及監督事項。
（八）農村家政、農家生活改善與高齡者推廣教育措施之策劃、協調及督導事項。
（九）農民離農轉業、創業、就業訓練之策劃及督導事項。
（十）農業推廣設施之建置與強化服務功能之策劃及督導事項。
（十一）輔導農會整合社區組織之策劃、協調及督導事項。
（十二）農業財團法人之輔導及監督事項。
（十三）其他有關農業推廣事項。
三、休閒產業科：
（一）休閒農業法規、政策之擬訂、策劃及監督事項。
（二）休閒農業區之劃定及輔導事項。
（三）休閒農業人才之培育及訓練事項。
（四）休閒農業行銷之擬訂、策劃及監督事項。
（五）休閒農場設置、輔導及監督事項。
（六）休閒農業公共建設之策劃及輔導事項。
（七）觀光農園、生態教育農園、市民農園等之設置、輔導及監督事項。
（八）農業產業文化之策劃及督導事項。
（九）地方料理與特產業務之策劃及輔導事項。
（十）其他有關休閒產業事項。
四、農民福利科：
（一）農民福利政策、法規之擬訂、策劃、協調、督導及配合事項。
（二）老年農民福利津貼措施之策劃及督導事項。
（三）農村婦女權益、福利與職業能力提昇之策劃及配合事項。
（四）農民保險之配合及督導事項。
（五）農民子女獎助就學金之策劃及督導事項。
（六）農業天然災害救助之策劃及督導事項。
（七）農業保險之策劃及督導事項。
（八）農業發展基金之策劃、運用、保管及督導事項。
（九）其他有關農民福利事項。