工務課掌理事項如下：
一、軌道與測量工程之規劃及設計。
二、工程災害調查及預防。
三、土木建築工程之採購（招標文件）、預算審核及工法研擬。
四、工務工程契約管理及查核。
五、土木建築工程及景觀生態保育。
六、工程進度管制及計價審查。
七、工程履約爭議處理。
八、工程竣工、驗收及決算。
九、工務工程統計與查核及相關技術之建立。
十、其他有關工務事項。