全大運由教育部（以下簡稱本部）統籌規劃，大專校院承辦，承辦之大專校院（以下簡稱承辦學校）所在地直轄市、縣（市）政府（以下簡稱地方政府）與有關機關團體及學校協辦。
本部應自行或委託國際大學運動總會（International UniversitySportsFederation,FISU）認可之中華民國大專院校體育總會（以下簡稱大專體總），依本準則規定及相關國際規範組成全大運組織委員會（以下簡稱組委會），辦理全大運規劃、籌辦及執行之輔導事宜，並主導籌辦工作之運動競賽及運動禁藥管制事宜。
組委會設置之單位及其任務如下：
一、輔導小組：全大運籌辦事務之輔導。
二、運動競賽小組：全大運競賽事務之審理。
三、運動禁藥管制小組：全大運運動禁藥管制之執行。
組委會組織章程、工作規範及輔導小組與運動競賽小組組織簡則、工作規範，由本部定之或委由大專體總擬訂，報本部核定；運動禁藥管制小組組織簡則、工作規範，由組委會擬訂，報本部核定。