訓練科職掌如下：
一、常年訓練之規劃、執行及考核事項。
二、員警精神教育之規劃及督導辦理事項。
三、案例教育之蒐集、編撰及督導實施事項。
四、員警心理輔導、諮商及晤談事項。
五、員警海事與安檢專業訓練之規劃、執行、督導及考核事項。
六、水上警察專業課程之規劃、教材之審核等事項。
七、員警出國進修考察之計畫、遴選及審核事項。
八、教育訓練之各項教學設施規劃及管理事項。
九、其他有關水上警察教育訓練業務事項。