有下列情形之一者，依本條例第三十六條規定處罰：
一、違反第六十二條第三項規定，鮪延繩釣漁船於兼營運搬船許可期間從事捕撈作業，或未於國內港口卸魚。
二、運搬船從事轉載，未遵守第六十七條第一項規定，規避、妨礙或拒絕搭載觀察員或接受主管機關指派之觀察員隨船執行任務。
三、違反第七十條第一項規定，未經許可即從事轉載。
四、違反第七十條第三項規定，未於許可轉載期間內轉載。但不包含第二項第二款情形。
五、違反第七十六條第一項規定，未經許可從事卸魚。
六、違反第七十六條第三項規定，未於許可卸魚期間內卸魚。但不包含第二項第五款情形。
七、違反第七十八條第一項規定，有規避、妨礙或拒絕漁獲查核，或未配合辦理同條第二項規定事項。
有下列情形之一者，依本條例第四十一條規定處罰：
一、我國籍運搬船或兼營運搬船違反第六十三條規定，與未列名在 WCPFC或 IATTC 漁船名單、塗改船名或統一編號之漁船進行轉載、加油或補給。
二、違反第七十條第三項規定，未於許可轉載期間內轉載，而有下列情形之一者：
（一）運搬船搭載 WCPFC 或 IATTC 區域觀察員計畫之觀察員隨船進行觀察任務，漁船或運搬船從事海上轉載。
（二）許可轉載期間後，於前鎮、小港臨海新村、東港鹽埔、旗津漁港或高雄港四十一號碼頭從事港內轉載。
三、違反第七十三條規定，於船位回報器斷訊未修復前進行轉載。
四、違反第七十四條規定，未於規定期限內報送轉載確認書。
五、屬第七十六條第三項但書之漁船，有下列情形之一者：
（一）未於許可卸魚期間內，於日本清水港口；泰國曼谷或宋卡港口卸魚。
（二）許可卸魚期間後，於前鎮、小港臨海新村、東港鹽埔、旗津漁港或高雄港四十一號碼頭卸魚。
六、違反第七十七條規定，未於規定期限內提交卸魚聲明書。