果樹及花卉產業組掌理事項如下：
一、果樹、花卉產業發展方案與研究之訂定、輔導、示範、推廣、執行及監督。
二、果樹、花卉集團化、企業化經營計畫之規劃、推動及監督。
三、果樹、花卉生產改進與產銷穩定措施之規劃、執行及監督。
四、果樹、花卉等作物設施智慧化生產措施之規劃、訂定、執行及監督。
五、果樹、花卉產品國內多元行銷、宣傳等方案之規劃、訂定、推廣、執行及監督；花卉批發市場經營管理及設施改善之輔導。
六、果樹、花卉外銷品質與數量之輔導、規劃、訂定及監督。
七、果樹、花卉產品採後處理發展方案之規劃、訂定、執行及監督。
八、果樹產品加工事業、加工技術研究、品質競賽、加工設施與技術之策劃、輔導及監督；跨產業釀酒事業之規劃、輔導及監督。
九、果樹、花卉產品共同運銷、集貨場、冷鏈、物流之規劃、輔導、執行及監督。
十、其他有關果樹及花卉產業事項。