土地所有權人得向當地鄉（鎮、市、區）公所申請土地受限補償，由鄉（鎮、市、區）公所納入年度水源保育與回饋計畫。鄉（鎮、市、區）公所於計畫核定後，辦理受理締結行政契約公告、契約造冊、查核及締結行政契約事項。
申請補償之土地為共有者，應由全體共有人共同申請之。
所有權人申請土地受限補償時，應檢具下列文件：
一、申請書：應載明土地所有權人姓名、地址、受限土地面積、土地使用分區、土地受限補償金係數、申請日期及其他必要事項。
二、土地所有權人身分證明文件影本。
三、最近一個月內地政機關核發之土地登記謄本。
四、受限土地位於都市計畫內者，應另提出土地使用分區證明書。但土地登記謄本已有記載者，免附。
五、其他必要文件。
前項第三款及第四款文件，得以政府機關電腦資料查明處理者，免附。
第一項公告前，因繼承、強制執行、法院之判決或其他依法律規定，於登記前已取得土地所有權或他項權利者，其權利人應於公告期間內，通知鄉（鎮、市、區）公所其取得權利之情事，並得於變更登記後申請土地受限補償。
第一項公告期間為三十日，利害關係人得於公告期間，附具理由及證據，向鄉（鎮、市、區）公所提出異議。
第三項第一款申請書格式，由中央主管機關定之。