藥廠廠房之建築及設施應符合下列規定：
一、廠房之建築，應堅固、安全、清潔、防蟲、防鼠、防塵。
二、室內牆壁、地面及天花板應採用耐水材料，牆壁及地面應用水泥、磨石子或舖設塑膠板、瓷磚或其他光潔建築材料，表面應保持平滑而無裂痕及縫隙，且應易於清潔而不發生粉塵，必要時並應採用易於消毒清洗之材料。地面應有適當傾斜，且無局部積水現象。
三、室內導管應選用表面不易積存塵埃或污垢之材料，並應力求隱蔽。
四、排水裝置之排水口應有防止廢水回流之設施。
五、工作場所外應設置供員工使用之休息室、浴室。
六、製造加工區域外應具備適當之盥洗設施；盥洗設施應與工作場所隔離。
七、污水、垃圾及其他廢棄物應以合乎衛生安全之方式處理。
八、藥廠應視作業需要設置一般用水處理、純化水處理、鍋爐或蒸餾水製造設施；供水設施應避免對產品造成污染。
九、藥廠應設置容器洗滌設施，對於眼用劑、注射劑及生物藥品或生物技術產品所用容器之洗滌設施，應注意防止污染，並獨立設置。
十、各動物室應依動物類別及製造、試驗工作性質予以適當區隔，並應與製造、分裝作業場所保持適當之隔離。