申請認證為驗證機構者，應為行政機關（構）、大學校院或非營利性質之法人、團體，並具備下列條件：
一、取得國際認證論壇（IAF） 會員核發之食品安全管理系統驗證機構認證（ISO/TS22003）證書。
二、置有專職之稽核員，並應具備下列資格之一：
（一）領有食品技師、畜牧技師、水產養殖技師、營養師或獸醫師證書。
（二）領有符合教育部採認規定之國內外專科以上學校食品、營養、家政、生活應用科學、畜牧、獸醫、化學、化工、農業化學、生物化學、生物、藥學、公共衛生或其他相關科、系、所或學位學程畢業證書。
前項第二款稽核員，應具有食品安全管制系統訓練六十小時、食品衛生安全與相關法令知能及至少二年以上稽查經驗。
前項稽查經驗，得以於食品工廠擔任專門職業人員、品質管制人員或衛生管理人員之年資抵充，並以抵充一年為限。