新藥支付價格之訂定原則如下：
一、第 1 類新藥：以十國藥價中位數核價。對於致力於國人族群特異性療效及安全性之研發，在國內實施臨床試驗達一定規模者，以十國藥價中位數之 1.1 倍（即加算百分之十）核價。
二、第 2 類新藥：
（一）以十國藥價中位數為上限。
（二）得依其臨床價值改善情形，從下列方法擇一核價：
1.十國藥價最低價
2.原產國藥價
3.國際藥價比例法
4.療程劑量比例法
5.複方製劑得採各單方健保支付價格合計乘以百分之七十，或各單方同成分規格藥品支付價格之中位數合計乘以百分之七十，或單一主成分價格核算藥價。
（三）依前二目核價原則計算後，符合下列條件者，得另予加算，但仍不得高於十國藥價中位數：
1.對於致力於國人族群特異性療效及安全性之研發，在國內實施臨床試驗達一定規模者，加算百分之十。
2.在國內進行藥物經濟學（PE）之臨床研究者，最高加算百分之十。
三、屬第一款及前款第三目之加算條件者，如作為核價參考品，其參考價格應依下列原則取其最低價︰
（一）以第一次列入本標準之支付價格，扣除第一款及前款第三目加算條件加計之金額。
（二）現行支付價格。
四、建議收載二項以上同成分劑型但不同規格之藥品，依前三款核價方式核價後，其餘品項得採規格量換算法計算藥價。
前項新藥得適用本標準第三十三條第一款規定。