營所稅組掌理事項如下：

一、營利事業所得稅稽徵作業之規劃及督導。

二、營利事業所得稅案件之查核及管制。

三、記帳士、記帳及報稅代理人、稅務代理人登錄、管理相關業務與記帳及報稅代理人專業訓練機構之管理。

四、營利事業所得稅相關稅務法令及記帳士法法令疑義之請釋及解答。

五、其他有關營利事業所得稅事項。

法務組掌理事項如下：

一、稅捐稽徵法、營利事業所得稅、綜合所得稅、遺產及贈與稅、營業稅、貨物稅、菸酒稅、證券交易稅、期貨交易稅、特種貨物及勞務稅行政救濟與違章業務及案件之規劃、審理、裁罰、督導及管制。

二、納稅者權利保護業務之規劃、執行、督導及管制。

三、違反記帳士法第三十四條案件之審理、處罰及行政救濟之擬議。

四、檢舉人獎金之提成及核發。

五、稅務法令之整理、彙編及適用疑義之研議。

六、國家賠償案件之處理。

七、其他有關各稅之行政救濟及違章行政事項、法務事項。