研發成果歸屬執行單位時，執行單位應建立下列制度，並指定專責人員及組織執行之：

執行單位如未能建立並執行前項各款制度，應委託合法設立之智慧財產權管理運用服務機構協助執行之。

本會或所屬機關（構）得針對前二項執行情形進行查核，執行單位或其委託之智慧財產權管理運用服務機構未能通過查核者，研發成果應歸屬國有。

執行單位為公、私立學校或政府研究機關（構）者，不適用前三項規定。

利益衝突迴避管理制度應包含下列各款事項：

有關利益迴避、資訊揭露之管理，於行政程序法、或其他法令另有規定者，應依其規定辦理。

執行單位應將研發成果之收入及支出單獨設帳管理，定期編製收支報表，送本會或所屬機關（構）備查，並於會計制度內增訂有關研發成果之會計事務處理事項。

執行單位應於內部稽核制度內增訂有關研發成果之稽核項目及程序，並確實執行稽核業務。

執行單位應每年檢附相關資料向本會或所屬機關（構）報告研發成果之管理及運用情形，本會或所屬機關（構）並得要求執行單位提出書面說明；未報告者，本會或所屬機關（構）得終止執行中補助計畫。

本會或所屬機關（構）與政府審計人員為監督研發成果之管理及運用，得定期或不定期實地查訪執行單位之研發成果運用情形及紀錄、收支報表或帳簿等相關文件，執行單位不得規避、妨礙或拒絕。

執行單位應與其研發人員簽訂契約，規範下列各款事項：

執行單位基於產業特性或執行科技計畫之需要，應與其研發人員約定離職後一定期間內，不得利用研發成果為自己或第三人從事相同或近似業務。但其新任職企業與執行單位已簽訂研發成果授權或讓與契約者，不在此限。

執行單位對於涉及研發成果之人員管理事宜，應訂定相關制度及規範。